Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN7O94888 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN7O94888 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms