Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAD1O00515 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAD1O00515 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LAD1O00515 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAD1O00515 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAD1O00515 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAD1O00515 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAD1O00515 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAD1O00515 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAD1O00515 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAD1O00515 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LAD1O00515 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAD1O00515 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAD1O00515 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAD1O00515 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAD1O00515 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAD1O00515 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAD1O00515 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAD1O00515 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAD1O00515 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAD1O00515 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAD1O00515 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAD1O00515 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAD1O00515 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAD1O00515 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAD1O00515 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAD1O00515 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAD1O00515 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAD1O00515 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAD1O00515 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAD1O00515 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAD1O00515 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAD1O00515 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms