Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FXYD1O00168 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD1O00168 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms