Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms