Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BNX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BNX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BNX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BNX3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BNX3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BNX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BNX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3BNX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BNX3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BNX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BNX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BNX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BNX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BNX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BNX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BNX3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms