Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB9F8W1W9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms