Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN2A8MW95 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN2A8MW95 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN2A8MW95 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN2A8MW95 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN2A8MW95 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
BECN2A8MW95 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN2A8MW95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN2A8MW95 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN2A8MW95 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms