Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01549A6NIU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms