Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC182A6NF36 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms