Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSC5DA1L4H1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSC5DA1L4H1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms