Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCE3A1L190 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE3A1L190 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1060.5 ms