Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 27.57□□□□□ -1.21e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.311e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 56.47□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 25.05□□□□□ -1.61e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.25□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.891e-323■■■■■ 127
NOLC1Q14978 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 36.5□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 125.2
NOLC1Q14978 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.19□□□□□ -1.741e-323■■■■■ 125.2
NOLC1Q14978 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 125.1
NOLC1Q14978 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 54.46□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 125.1
NOLC1Q14978 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 124.6
NOLC1Q14978 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.191e-323■■■■■ 121
NOLC1Q14978 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.661e-323■■■■■ 120.5
NOLC1Q14978 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.621e-323■■■■■ 120.5
NOLC1Q14978 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.124e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 313.39□□□□□ -0.274e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 513.39□□□□□ -0.274e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.614e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 510.17□□□□□ -0.784e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.344e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.034e-266■■■■■ 120.4
NOLC1Q14978 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 521.62■■□□□ 1.051e-323■■■■■ 118.9
NOLC1Q14978 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-323■■■■■ 118.9
NOLC1Q14978 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.31e-323■■■■■ 116.4
NOLC1Q14978 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 520.35■□□□□ 0.851e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 519.13■□□□□ 0.651e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 310.37□□□□□ -0.751e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 49.31□□□□□ -0.921e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.221e-323■■■■■ 115.9
NOLC1Q14978 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 212.99□□□□□ -0.333e-140■■■■■ 113.5
NOLC1Q14978 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-140■■■■■ 113.5
NOLC1Q14978 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-140■■■■■ 113.5
NOLC1Q14978 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.82□□□□□ -1.163e-140■■■■■ 113.5
NOLC1Q14978 EIF4A2-215ENST00000467585 570 ntTSL 214.16□□□□□ -0.141e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-208ENST00000445596 600 ntTSL 213.67□□□□□ -0.221e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-227ENST00000498746 579 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-211ENST00000465222 676 ntTSL 27.03□□□□□ -1.281e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-212ENST00000465267 1054 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-221ENST00000491473 579 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-224ENST00000495049 576 ntTSL 26.58□□□□□ -1.361e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-210ENST00000465032 578 ntTSL 26.58□□□□□ -1.361e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-220ENST00000486805 590 ntTSL 23.94□□□□□ -1.781e-109■■■■■ 112.4
NOLC1Q14978 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 109.8
NOLC1Q14978 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.61e-323■■■■■ 109.8
NOLC1Q14978 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.81□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 109.8
NOLC1Q14978 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.92□□□□□ -1.781e-323■■■■■ 108
NOLC1Q14978 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.492e-80■■■■■ 106.1
NOLC1Q14978 SNORD91B-201ENST00000391250 95 nt4.26□□□□□ -1.732e-80■■■■■ 106.1
NOLC1Q14978 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.189e-81■■■■■ 105.7
NOLC1Q14978 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.44□□□□□ -1.549e-81■■■■■ 105.7
NOLC1Q14978 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC9.41□□□□□ -0.91e-22■■■■■ 105.2
NOLC1Q14978 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt2.09□□□□□ -2.071e-22■■■■■ 105.2
NOLC1Q14978 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 214.21□□□□□ -0.131e-323■■■■■ 104.7
NOLC1Q14978 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 511.41□□□□□ -0.581e-323■■■■■ 104.7
NOLC1Q14978 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-323■■■■■ 104.7
NOLC1Q14978 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-323■■■■■ 104.7
NOLC1Q14978 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.03□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 104.7
NOLC1Q14978 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.662e-111■■■■■ 103.7
NOLC1Q14978 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 101.1
NOLC1Q14978 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.241e-323■■■■■ 101
NOLC1Q14978 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 213.98□□□□□ -0.171e-323■■■■■ 99.8
NOLC1Q14978 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 98.9
NOLC1Q14978 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 29.05□□□□□ -0.965e-29■■■■■ 98.1
NOLC1Q14978 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.045e-29■■■■■ 98.1
NOLC1Q14978 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.045e-29■■■■■ 98.1
NOLC1Q14978 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-32■■■■■ 97.7
NOLC1Q14978 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 25.06□□□□□ -1.62e-111■■■■■ 97.7
NOLC1Q14978 SNRPE-206ENST00000483099 967 ntTSL 221.42■■□□□ 1.024e-13■■■■■ 97.2
NOLC1Q14978 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-13■■■■■ 97.2
NOLC1Q14978 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.894e-13■■■■■ 97.2
NOLC1Q14978 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.87□□□□□ -1.474e-13■■■■■ 97.2
NOLC1Q14978 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 219.59■□□□□ 0.731e-323■■■■■ 95.4
NOLC1Q14978 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 94.9
NOLC1Q14978 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.94□□□□□ -1.143e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 37.42□□□□□ -1.223e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 36.62□□□□□ -1.353e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 56.15□□□□□ -1.423e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.553e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.27□□□□□ -1.573e-45■■■■■ 92.7
NOLC1Q14978 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.952e-75■■■■■ 92.6
NOLC1Q14978 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 510.21□□□□□ -0.774e-52■■■■■ 92.2
NOLC1Q14978 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.784e-52■■■■■ 92.2
NOLC1Q14978 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-323■■■■■ 91.1
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 78.8 ms