RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
RABGGTB-204ENST00000461653 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.31■■□□□ 1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD1Q16676 465 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTB-204ENST00000461653 ADRA2BP18089 450 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTB-204ENST00000461653 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGGTB-204ENST00000461653 MSH5O43196 834 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEDQ86YR6 584 aa19■□□□□ 0.63
RABGGTB-204ENST00000461653 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.63■□□□□ 0.57
RABGGTB-204ENST00000461653 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.19■□□□□ 0.5
RABGGTB-204ENST00000461653 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.75■□□□□ 0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNA4P22459 653 aa17.74■□□□□ 0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.27■□□□□ 0.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF39Q9H2S5 420 aa17.18■□□□□ 0.34
RABGGTB-204ENST00000461653 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.13■□□□□ 0.33
RABGGTB-204ENST00000461653 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
RABGGTB-204ENST00000461653 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC4A2P04920 1241 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTB-204ENST00000461653 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RABGGTB-204ENST00000461653 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPN15O75808 1086 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 APLP2Q06481 763 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGGTB-204ENST00000461653 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB22O15209 634 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGGTB-204ENST00000461653 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 DSG3P32926 999 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCB7O75027 752 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-204ENST00000461653 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTB-204ENST00000461653 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTB-204ENST00000461653 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTB-204ENST00000461653 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTB-204ENST00000461653 POLA2Q14181 598 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTB-204ENST00000461653 FBLN2P98095 1184 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTB-204ENST00000461653 OSCARQ8IYS5 282 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTB-204ENST00000461653 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGGTB-204ENST00000461653 AKT1S1Q96B36 256 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE6P0CI01 402 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEHQ6S545 545 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PITPNM1O00562 1244 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR29P0C7W0 189 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTB-204ENST00000461653 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTB-204ENST00000461653 PROM2Q8N271 834 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGGTB-204ENST00000461653 CHADLQ6NUI6 762 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGGTB-204ENST00000461653 FKBP8Q14318 412 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGGTB-204ENST00000461653 HAX1O00165 279 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGGTB-204ENST00000461653 CREBZFQ9NS37 354 aa14.27□□□□□ -0.12
RABGGTB-204ENST00000461653 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RABGGTB-204ENST00000461653 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-204ENST00000461653 EVX2Q03828 476 aa14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-204ENST00000461653 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
RABGGTB-204ENST00000461653 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
RABGGTB-204ENST00000461653 MIER1Q8N108 512 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-204ENST00000461653 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.03□□□□□ -0.16
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHG5O94827 1062 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO3Q9UK99 471 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGGTB-204ENST00000461653 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGGTB-204ENST00000461653 GABBR2O75899 941 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 CLCN6P51797 869 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
RABGGTB-204ENST00000461653 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF12Q96QT6 1004 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-204ENST00000461653 RASEFQ8IZ41 740 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGGTB-204ENST00000461653 NUBP1P53384 320 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms