Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMF1-BGLAPU3KQ54 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PMF1-BGLAPU3KQ54 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms