Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC61Q9Y6R9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC61Q9Y6R9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CCDC61Q9Y6R9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms