Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC3AQ9Y2H6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNDC3AQ9Y2H6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC3AQ9Y2H6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms