Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1AQ9Y294 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1AQ9Y294 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1AQ9Y294 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms