Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFSF18Q9UNG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFSF18Q9UNG2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms