Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX25Q9UHL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX25Q9UHL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms