Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APEX2Q9UBZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms