Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK3Q9UBP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK3Q9UBP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms