Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAE1Q9UBE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAE1Q9UBE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms