Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX16Q9P0S2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX16Q9P0S2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX16Q9P0S2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX16Q9P0S2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX16Q9P0S2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COX16Q9P0S2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms