Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH8Q9NYR8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RDH8Q9NYR8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms