Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NECAP2Q9NVZ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECAP2Q9NVZ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms