Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX1Q9NSU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX1Q9NSU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms