Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASS4Q9NQ75 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASS4Q9NQ75 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms