Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A20Q9NP91 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A20Q9NP91 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A20Q9NP91 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms