Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIL1Q9H173 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIL1Q9H173 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIL1Q9H173 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SIL1Q9H173 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms