Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARHL1Q9BZE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BARHL1Q9BZE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms