Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms