Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSPAN18Q96SJ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN18Q96SJ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN18Q96SJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms