Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOX2Q96NM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TOX2Q96NM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOX2Q96NM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms