Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCLT1Q96NL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCLT1Q96NL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms