Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf42Q96LP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf42Q96LP6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf42Q96LP6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf42Q96LP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf42Q96LP6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf42Q96LP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf42Q96LP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf42Q96LP6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms