Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-226ENST00000640351 1388 ntTSL 515.19■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SLC7A5-202ENST00000563489 780 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CREM-240ENST00000489388 1022 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AP000347.2-203ENST00000434893 403 ntTSL 215□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RFX2-223ENST00000592883 589 ntTSL 414.89□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 HAAO-204ENST00000404451 651 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 514.56□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC073111.5-201ENST00000641330 2582 nt14.36□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.28□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CLU-212ENST00000522413 654 ntTSL 313.88□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 IDI2-AS1-202ENST00000428780 1054 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 312.89□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 412.89□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RHPN2-204ENST00000588388 2378 ntTSL 212.66□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RSU1-204ENST00000464074 1141 ntTSL 512.64□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 LMCD1-202ENST00000397386 1501 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-212ENST00000638717 2118 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 412.29□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 78.5
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