RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489388.5

CREM-240, Transcript of cAMP responsive element modulator, humanhuman

TSL 2

Gene CREM, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREM-240ENST00000489388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.52■■■■■ 4.24
CREM-240ENST00000489388 ABCC9O60706 1549 aa39.36■■■■□ 3.89
CREM-240ENST00000489388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.27■■■■□ 3.72
CREM-240ENST00000489388 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.84■■■■□ 3.65
CREM-240ENST00000489388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.74■■■■□ 3.47
CREM-240ENST00000489388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
CREM-240ENST00000489388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.13■■■■□ 3.37
CREM-240ENST00000489388 NACADO15069 1562 aa36.12■■■■□ 3.37
CREM-240ENST00000489388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.97■■■■□ 3.35
CREM-240ENST00000489388 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.81■■■■□ 3.32
CREM-240ENST00000489388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.71■■■■□ 3.31
CREM-240ENST00000489388 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.58■■■■□ 3.29
CREM-240ENST00000489388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.46■■■■□ 3.27
CREM-240ENST00000489388 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.11■■■■□ 3.21
CREM-240ENST00000489388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.04■■■■□ 3.2
CREM-240ENST00000489388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CREM-240ENST00000489388 SCRIBQ14160 1630 aa34.47■■■■□ 3.11
CREM-240ENST00000489388 CUX2O14529 1486 aa34.45■■■■□ 3.1
CREM-240ENST00000489388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.14■■■■□ 3.06
CREM-240ENST00000489388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CREM-240ENST00000489388 ERCC6Q03468 1493 aa34.04■■■■□ 3.04
CREM-240ENST00000489388 TRIM41Q8WV44 630 aa33.98■■■■□ 3.03
CREM-240ENST00000489388 NESP48681 1621 aa33.42■■■□□ 2.94
CREM-240ENST00000489388 NCAPD3P42695 1498 aa33.39■■■□□ 2.94
CREM-240ENST00000489388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
CREM-240ENST00000489388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.11■■■□□ 2.89
CREM-240ENST00000489388 SMARCA2P51531 1590 aa33.04■■■□□ 2.88
CREM-240ENST00000489388 HMGXB3Q12766 1538 aa33■■■□□ 2.87
CREM-240ENST00000489388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.91■■■□□ 2.86
CREM-240ENST00000489388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.86■■■□□ 2.85
CREM-240ENST00000489388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
CREM-240ENST00000489388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.71■■■□□ 2.83
CREM-240ENST00000489388 SMARCA4P51532 1647 aa32.7■■■□□ 2.83
CREM-240ENST00000489388 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
CREM-240ENST00000489388 OSCARQ8IYS5 282 aa32.64■■■□□ 2.82
CREM-240ENST00000489388 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.55■■■□□ 2.8
CREM-240ENST00000489388 WDR62O43379 1518 aa32.51■■■□□ 2.8
CREM-240ENST00000489388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.43■■■□□ 2.78
CREM-240ENST00000489388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.43■■■□□ 2.78
CREM-240ENST00000489388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.43■■■□□ 2.78
CREM-240ENST00000489388 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.36■■■□□ 2.77
CREM-240ENST00000489388 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.32■■■□□ 2.76
CREM-240ENST00000489388 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CREM-240ENST00000489388 ARHGEF11O15085 1522 aa32.16■■■□□ 2.74
CREM-240ENST00000489388 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CREM-240ENST00000489388 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.12■■■□□ 2.73
CREM-240ENST00000489388 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.03■■■□□ 2.72
CREM-240ENST00000489388 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.02■■■□□ 2.72
CREM-240ENST00000489388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
CREM-240ENST00000489388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
CREM-240ENST00000489388 ARAP1Q96P48 1450 aa31.77■■■□□ 2.68
CREM-240ENST00000489388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CREM-240ENST00000489388 CFTRP13569 1480 aa31.65■■■□□ 2.66
CREM-240ENST00000489388 WIZO95785 1651 aa31.57■■■□□ 2.64
CREM-240ENST00000489388 IFT140Q96RY7 1462 aa31.52■■■□□ 2.64
CREM-240ENST00000489388 CHD1O14646 1710 aa31.46■■■□□ 2.63
CREM-240ENST00000489388 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CREM-240ENST00000489388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CREM-240ENST00000489388 FBLN2P98095 1184 aa31.28■■■□□ 2.6
CREM-240ENST00000489388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
CREM-240ENST00000489388 TOPBP1Q92547 1522 aa31.2■■■□□ 2.59
CREM-240ENST00000489388 PRDM2Q13029 1718 aa31.18■■■□□ 2.58
CREM-240ENST00000489388 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CREM-240ENST00000489388 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.05■■■□□ 2.56
CREM-240ENST00000489388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CREM-240ENST00000489388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CREM-240ENST00000489388 ABCC8Q09428 1581 aa30.96■■■□□ 2.55
CREM-240ENST00000489388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.94■■■□□ 2.54
CREM-240ENST00000489388 SYNJ1O43426 1573 aa30.86■■■□□ 2.53
CREM-240ENST00000489388 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.84■■■□□ 2.53
CREM-240ENST00000489388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.83■■■□□ 2.53
CREM-240ENST00000489388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CREM-240ENST00000489388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CREM-240ENST00000489388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CREM-240ENST00000489388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.75■■■□□ 2.51
CREM-240ENST00000489388 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.7■■■□□ 2.51
CREM-240ENST00000489388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CREM-240ENST00000489388 SOGA1O94964 1423 aa30.62■■■□□ 2.49
CREM-240ENST00000489388 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.58■■■□□ 2.49
CREM-240ENST00000489388 SYNJ2O15056 1496 aa30.57■■■□□ 2.48
CREM-240ENST00000489388 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.56■■■□□ 2.48
CREM-240ENST00000489388 WDR97A6NE52 1622 aa30.54■■■□□ 2.48
CREM-240ENST00000489388 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.53■■■□□ 2.48
CREM-240ENST00000489388 GRIN2BQ13224 1484 aa30.5■■■□□ 2.47
CREM-240ENST00000489388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.4■■■□□ 2.46
CREM-240ENST00000489388 PBRM1Q86U86 1689 aa30.3■■■□□ 2.44
CREM-240ENST00000489388 CEP170Q5SW79 1584 aa30.28■■■□□ 2.44
CREM-240ENST00000489388 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.23■■■□□ 2.43
CREM-240ENST00000489388 KDM6BO15054 1643 aa30.19■■■□□ 2.42
CREM-240ENST00000489388 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.18■■■□□ 2.42
CREM-240ENST00000489388 CUX1P39880 1505 aa30.16■■■□□ 2.42
CREM-240ENST00000489388 GRIN2AQ12879 1464 aa30.12■■■□□ 2.41
CREM-240ENST00000489388 SHROOM2Q13796 1616 aa30.11■■■□□ 2.41
CREM-240ENST00000489388 NUP160Q12769 1436 aa30.08■■■□□ 2.41
CREM-240ENST00000489388 DIP2BQ9P265 1576 aa30.07■■■□□ 2.4
CREM-240ENST00000489388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.05■■■□□ 2.4
CREM-240ENST00000489388 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.04■■■□□ 2.4
CREM-240ENST00000489388 MAPKBP1O60336 1514 aa29.98■■■□□ 2.39
CREM-240ENST00000489388 ADGRL1O94910 1474 aa29.97■■■□□ 2.39
CREM-240ENST00000489388 TSPOAP1O95153 1857 aa29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms