Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRIPQ8WXE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRIPQ8WXE1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms