Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFT2D1Q8WV19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms