Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DTX3LQ8TDB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DTX3LQ8TDB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms