Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE00

TMEM104, Transmembrane protein 104, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM104Q8NE00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM104Q8NE00 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM104Q8NE00 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM104Q8NE00 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM104Q8NE00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM104Q8NE00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms