Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAAF3Q8N9W5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAAF3Q8N9W5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF3Q8N9W5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms