Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf163Q8N9P6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf163Q8N9P6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf163Q8N9P6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms