Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PPARGC1BQ86YN6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPARGC1BQ86YN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms