Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDXQ7Z353 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDXQ7Z353 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms