Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC62Q6P9F0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC62Q6P9F0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC62Q6P9F0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms