Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms