Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRNIPQ6NTE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRNIPQ6NTE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRNIPQ6NTE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRNIPQ6NTE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRNIPQ6NTE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRNIPQ6NTE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRNIPQ6NTE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms