Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA3Q6AZY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARA3Q6AZY7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA3Q6AZY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms