Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPGRIP1LQ68CZ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPGRIP1LQ68CZ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
RPGRIP1LQ68CZ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RPGRIP1LQ68CZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms